Po sukcesie wcześniejszej części gry, twórcy idą za ciosem, ale nie boją się zmian! Ze szczytu Megacity S1-9 Sovereign Khan rządzi żelazną pięścią. Pod gnijącymi fundamentami miasta mściwy wojownik wyrusza w podróż, by go zamordować. Gra dzieje się na 5 lat przed wydarzeniami z Slave Zero. Slave Zero X wniesie nowe życie do świata, w którym przerażające, żywe maszyny znane jako Slaves (Niewolnicy) są przygotowane, by stać się najnowszymi narzędziami wojennymi w długiej i krwawej historii ludzkości. Tajna grupa wojowników znana jako The Guardians ma nadzieję powstrzymać uwolnienie tych biomechów do świata, ale jeden szermierz w ich szeregach ma inny pomysł: użyć przeciw wrogowi jego własnej broni. Łącząc się ze skradzionym prototypem jednostki Slave, Shou stanie się wściekłym diabłem dążącym do zabicia fałszywego boga.
